Diferencia en texturas

Eso puede ser el Specular Color. Yo también aprecié alguna ligera diferencia en los modelos.
Cuando te descargas un mod externo (en .obj) todo vendrá compilado de una forma que, al pasarlo a .msh, puede perder calidad (como si de un .avi pasaras a un .mp4, todo más comprimidito, o como si de un surround 5.1 pasaras a un stereo). Cuando lo metes en TM, el modelo se presta a los "gráficos" de este programa. Y cuando finalmente lo pasas al juego, se presta también a otro cambio en los gráficos, entre ellos, que hay una iluminación y unos lightmap en los sets.

Creo que el MED funciona como un render, y es un Mod Tool sacado a posteriori del juego. Por eso lo verás como en fullbright, sin sombras ni nada, y lo suyo es que tenga el parecido más similar al .obj que usaste en Blender.
Creo que el TM en el rodaje funciona un poco diferente (lo sé porque los modelos de Sketchfab se ven "desenfocados" en el rodaje, pero en MED y posproducción se arregla), pero que en Posproducción se vuelve a hacer otro render solo que se le incluyen los efectos del juego como la iluminación del set y todo eso.

¿Has tomado esas imágenes en posproducción?
Y sobre lo del color specular, sí que parecía en el 010 Editor que algunos materiales van al nivel 255 en el RGB del color specular del modelo.

Hace poco he tenido el error este del Runtime error con unos .msh del Sketchfab de mucho peso, y los he vuelto a reexportar en .msh varias veces. El resultado es que en algunos se cambiaban estos números en el Diffuse, entre 0 y 255. Lo suyo sería comprobar estos valores por si tocarlos los puede dejar en su definición anterior. Imagino que el material lo que hace es aplicarle algo superpuesto a la textura, como el brillo, alfa, sombras, etc. Cosillas que se solucionarían "solas" con el Self Iluminated.

A lo mejor, por decir una barbaridad, cada vez que se pasa algo a .msh se le aplica un % a ciertos parámetros, de modo que cuando tú reconviertes un .msh en otro .msh ese % se reduce o cambia para no duplicar los mismos efectos. Si a la primera conversión se le añade un poco de color specular, a la segunda reconversión no se le añadiría la misma cantidad de color specular, por decir algo.
Vamos, que aunque te cambien los parámetros en Blender, seguramente no vas a apreciar ninguna diferencia. Eso es porque el render de Blender no es el mismo que el render del juego. Acuérdate que para exportar en canal alfa desde Blender hay aproximadamente 3 'Alpha' de los cuales 1 se aplica al material y 2 se aplican al renderizado de blender.

Yo me iría a la columna de la derecha, donde pone Textura, que veo que tiene marcado Specular Y en el Map Input es donde toqué lo del Alfa. A lo mejor ahí :Good:

PD: Luego aparte si la textura inicial del peinado llevaba el alpha (que no siempre es perfecto, a veces hay unos pocos píxeles rodeando el cabello), al reaplicar el alpha supuestamente se podría entorpecer la calidad del efecto anterior

Por esa regla de 3, ¿has probado en borrar materiales, texturas, purgado, y reintroducir la misma textura en la reconversión a .msh?